PMseq Datician病原专家分析系统是华大基因(300676)自主开发的智能集成化本地生信分析服务器,可与PMseq 病原高通量测序实验过程自动偶联,一键智能生成检测报告,无需专业的生信分析人员,保证了数据安全和结果准确。
基于PMseq Datician病原专家分析系统的PM Display、PM Online组件,可轻松实现线上数据管理分析、报告智能生成功能,让PMseq 组学大数据分析简单易用!
PM Display智能报告系统
PM Display智能报告系统是配套PMseq 病原微生物高通量测序产品的组学大数据分析系统,实现对PMseq 病原检测后的检测结果归集、存储、统计、分析、数据挖掘。使用可视化操作界面,人工确定检出病原为最终临床报告。该系统带自我学习功能,在使用过程中不断结合用户给出的结果优化默认推荐病原,并能结合PM Online给出不同病原的检出分布。
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PM Online线上数据管理系统
PM Online线上数据管理系统集成了PMseq 自动化病原分析数据平台,使得病原鉴定组学数据在中心本地化集中存储,实现用户在线授权访问,可以协助医院实现病原组学检测数据管理、病原统计、检出频率、病原谱和时空分布等统计分析功能;并且支持数据共享合作,临床和基因组学科学研究,可为医院及疾控等机构的大数据分析与再挖掘提供强有力的技术平台支撑。
升级亮点
数据定时交互
PM Display与PM Online进行数据定时交互,实现报告解读到数据收集统计的一体化和自动化。
更完善!更全面!更科学!
PMseq 报告配置不断更新升级,使其更完善!更全面!更科学!配置PMseq 默认报告模板以及个性化报告模板;上线“检出疑似耐药基因列表”和“检出疑似毒力基因列表”;升级“参考文献”和“微生物说明”数据库!
报告节选
数据更丰富
新增“样本类型特异性的病原微生物检出率”,辅助解读人员对出列微生物更好地判读。
助力城市Q热疫情流行监控
2021年7月,中山大学附属第五医院联合华大基因研究团队,在国际期刊《PLoS Negl Trop Dis》(IF=4.4) 上发表一篇科学论文,阐述了2018年底至2019年初,研究者利用宏基因组测序技术 (mNGS) 在珠海监控到了城市Q热疫情流行[1]。
研究者对疑似感染的未知病原发热查因患者进行PMseq 检测,监测到中大五院2018年4月份开始检测到贝纳特柯克斯体,确诊Q热病例,并在接下来的十几个月中持续检测到该病原体,且在2018年底和2019年初达到了检出率的高峰。
研究者在该病原体检出最高峰时期采集了珠海市唯一屠宰场的牛、羊血液,同样用PMseq 检测到了较高比例的贝纳特柯克斯体阳性样本。然后,研究者利用该批病人的手机定位数据,结合牛、羊样本检测结果,推测了一起可能由动物传染、聚集传播的城市Q热流行事件[1]。
病原体mNGS检测已经全新开启医院本地化建设的新篇章。基于PMseq Datician病原专家分析系统的PM Display、PM Online组件升级,助力数据管理及报告解读更智能,让病原宏基因组测序数据简单易用!华大基因将不懈努力提升产品质量,为临床精准诊疗提供更全面的解决方案,让更多百姓受益于基因科技。